Laguna San Rafael
Forma parte del Parque Nacional Laguna San Rafael, que comprende una extensión de 1.742.000 hectáreas. La Laguna San Rafael fue declarada Reserva de la Biósfera en 1979 por la Unesco.

Desde Puerto Chacabuco se navega hacia el sur para ingresar al Fiordo Aisén, se continúa por el Canal Costa para internarse en el Estuario Elefantes, que llega, tras un hermoso viaje, a la Laguna San Rafael.

La Laguna San Rafael tiene la muestra más imponente de belleza de la naturaleza austral, en ella desemboca un gigantesco ventisquero con miles de témpanos de todos tamaños. Cuando se desprenden de su muralla de hielo eterno y caen a las aguas, sobrecoge la grandeza telúrica del espectáculo.

Lago Riesco
Se ubica a 26 Km. de Puerto Aisén y el camino de acceso se encuentra en buenas condiciones. Este lago es inmenso y se puede apreciar una abundante vegetación en la zona. Tiene 14 km2. de superficie y es un lugar de gran belleza, digno de toda admiración.

Sus aguas, siempre tranquilas, ofrecen un sinnúmero de posibilidades para practicar variados deportes, entre ellos, la pesca deportiva.

Puerto Chacabuco
Se ubica a 14 Km. de Puerto Aisén. Se considera el punto de entrada a la región de Aisén por vía marítima y es el de mayor importancia en la zona por su actividad portuaria. Aquí transitan naves de gran calado y presenta, también, un constante movimiento de transbordadores, que arriban de Puerto Montt, y pintorescas lanchas pesqueras que vienen de alta mar.

Desde el mirador de Puerto Chacabuco se puede apreciar toda la bahía con la majestuosa Cordillera de los Andes como fondo.

Este puerto desplazó a Puerto Aisén en la década del 60 y, actualmente, es terminal de transbordadores y puerto de barcos mayores. En el lugar existe servicio de hotelería y alimentación.

Parque Nacional Río Simpson
Está ubicado a 32 Km. al noroeste de Puerto Aisén. La superficie del parque es de 40.452 hectáreas. Posee un relieve accidentado y con cumbres superiores a los 1.600 mts., lo que da origen a valles y angostas quebradas por los que bajan los ríos. Destacan los ríos Correntoso y Cascada de la Virgen, afluentes del Simpson, ambos rodeados de bellos paisajes y exuberante vegetación.

Se accede a esta área por el camino pavimentado Puerto Chacabuco - Coihaique a 37 Km. Entre los lugares más bellos destacan, indudablemente, la cascada de la Virgen y el salto Velo de Novia.

Monumento Natural Cinco Hermanas
Se ubica a 50 Km. de la ciudad de Puerto Aisén, en la entrada del Fiordo Aisén. Se compone de 6 pequeñas islas que, en conjunto, abarcan una superficie de 228 hectáreas. Las especies arbóreas representativas son Canelo, Coigüe de Chiloé y Tepa.

En relación con la fauna, el grupo más común lo constituyen las aves entre las que destacan especies marinas como Gaviota, Cormorán y Cormorán imperial, y entre los mamíferos, el Chungungo y el lobo marino común.

Valle Pangal
Está ubicado a 8 km. de Puerto Aisén por la carretera Aisén - Coihaique. A través de un desvío, en pocos minutos, se encontrará con una magnífica vista del Valle del Río Aisén y, unos kilómetros más allá, con la pasarela sobre el Río Pangal. Internándose 8 Km. más por este valle, encontrará una caudalosa y hermosa caída de agua llamada el Salto del León.

Villa Mañihuales
Se ubica a 20 Km. de Puerto Aisén por la carretera Aisén –Coihaique; existe un desvío que lo conducirá al pintoresco pueblo campesino de Villa Mañihuales. En el trayecto hacia el poblado tendrá bordeará el hermoso Río Mañihuales cruzando varios puentes.

Laguna Los Palos
Se sitúa a 10 km. de Puerto Aisén en un valle de la Cordillera de los Andes. Se puede acceder por un camino angosto y sinuoso cruzando un hermoso puente colgante sobre el Río Los Palos.

Tanto el Río Los Palos y la Laguna Los Palos son lugares excelentes para practicar la pesca deportiva. También se puede realizar actividades como observación de flora y fauna, fotografía y caminatas.

Lago Portales
Está ubicado a 20 Km. de Puerto Aisén y a 80 Km. de la ciudad de Coihaique. Está rodeado de una vegetación impresionante. Puede acceder por tierra cruzando en balsa por el Río Blanco.

Es un excelente lugar para practicar la pesca deportiva, en particular la pesca con mosca, además de realizar actividades como observación de flora y fauna, fotografía, caminatas, kayak, canoa y natación.

Laguna Fantasma
Está ubicada al norte del trazado caminero, rodeada de bosques hasta su orilla, lo que le da un aspecto interesante.

Termas de Quitralco
Se ubican en el fiordo Quitralco, en el trayecto hacia Puerto Aisén. Se consideran entre los centros de fuentes termales más remotos de Chile y alcanzan una temperaturas entre 50°C y 65°C.

Termas de Chilconal
Se ubican en el fiordo de Aisén a 40 Km. al oeste de Puerto Aisén, a 2.30 horas de navegación desde Puerto Chacabuco y a 50 mt. sobre el nivel del mar.

Sus aguas termales fluyen a una temperatura que varia entre 34 y 35° C y se recomiendan para el tratamiento de artritis y dolores reumáticos en general. Las Termas del Chilconal es el sistema de termas más cercano a Puerto Aisén y Coihaique, y está asociada al eje volcánico andino. La temporada de funcionamiento y atención es entre septiembre y marzo.

Volcán Hudson
Se ubica a 137 Km. al sur de Coihaique y también al sur del Puerto Aisén. Se eleva 1.905 metros sobre el nivel del mar. Este volcán produjo la segunda erupción más grande de Chile en agosto de 1971, lo que destruyó el Valle Huemules, pequeña localidad de la montaña patagónica de Aisén. Su última erupción se registró en el año 1991.

Volcán Maca
Es un volcán inactivo de 2.960 mts. cercano al Cerro Pérez, ubicado a 40 Km. de Puerto Aisén aproximadamente.

Islas Huichas
Se sitúan al noroeste de la desembocadura del fiordo Aisén, en una superficie de 2,5 km2. En el sector podrá visitar Puerto Aguirre y Caleta Andrade, de pintoresca estructura urbana.